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從頭測序 是一種分析和鑒定肽序列和一些翻譯后修飾蛋白的方法。 與其他一些分析方法依賴于已知的蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫或已知的質(zhì)譜數(shù)據(jù)庫不同,de novo 測序使用串聯(lián)質(zhì)譜法根據(jù)肽段的斷裂特征進行直接分析。 因此,蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中未包含的肽序列、新物種的蛋白質(zhì)序列和基因組尚未測序的蛋白質(zhì)序列都可以進行分析。 該方法開發(fā)的軟件包括 PepNovo、PEAKS 和 pNovo。
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輝駿生物-蛋白質(zhì)磷酸化對于調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)定位和蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用至關(guān)重要,這些相互作用構(gòu)成了許多細胞信號網(wǎng)絡(luò)的基礎(chǔ)。 基于磷酸化的信號傳導(dǎo)通常采用級聯(lián)的形式,其中連續(xù)的蛋白質(zhì)磷酸化導(dǎo)致蛋白質(zhì)穩(wěn)定性、功能和定位的變化。
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輝駿生物-提供His標簽蛋白表達但不結(jié)合Ni-NTA色譜柱方法如下,可以從以下3點著手:1.您的增溶緩沖液是否需要優(yōu)化?2.您的親和樹脂新鮮有效嗎? 3.您的蛋白質(zhì)是否隱藏了組氨酸標簽?
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自下而上和自上而下是兩種基于生物量光譜法的蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法。 自下而上,也稱為霰彈槍,是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中廣泛使用的質(zhì)譜技術(shù),是一種將大蛋白質(zhì)片段消化/酶促溶解成小肽進行分析的傳統(tǒng)方法。 自上而下可以直接對完整蛋白質(zhì)進行測序,包括翻譯后修飾的蛋白質(zhì)和其他大片段蛋白質(zhì),而不僅僅是肽。
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有些物種的數(shù)據(jù)庫質(zhì)量不好,包含的蛋白數(shù)目過少,這種可以考慮換大一級的物種分類數(shù)據(jù)庫,或者選擇在進化樹上同源性較近的、研究比較清楚的、基因組數(shù)據(jù)庫相對完整的模式物種的數(shù)據(jù)庫重新查庫。
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PCR反應(yīng)條件的選擇技巧主要體現(xiàn)在溫度、時間和循環(huán)次數(shù)上,溫度過高,延伸時間不夠都會對實驗結(jié)果有很大的影響,輝駿生物總結(jié)了以下幾點關(guān)于PCR反應(yīng)條件的選擇技巧及優(yōu)化方法。
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選擇“正確”標簽可能是一項艱巨的任務(wù)。理想的標簽將幫助你獲得可溶性蛋白,簡化你的純化方案,并且不會干擾下游應(yīng)用。
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還是分不清IP,Co-IP,GST pull down?輝駿生物在下文除了介紹介紹IP與Co-IP區(qū)別知識要點,也將研究蛋白互作幾種方法(酵母雙雜交系統(tǒng)(Y2H),CO-IP的關(guān)系,GST-Pull Down)之間的區(qū)別以及優(yōu)缺點簡明扼要的收納進來。
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定量PCR中有一個很重要的概念—Ct值.那么Ct值究竟是什么呢,輝駿生物來給大家講一講。
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雙向電泳一次可以從細胞、組織或其它生物樣本中分離上千種蛋白質(zhì),凝膠上的斑點都對應(yīng)著樣品中的蛋白質(zhì),且各種蛋白質(zhì)的等電點,分子量和含量的信息都能通過質(zhì)譜鑒定和軟件分析獲得。
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在磁珠法核酸提取的過程中,樣本的前處理工作對整個提取結(jié)果會有至關(guān)重要的影響。當(dāng)然,選取合適的磁珠,更能使提取結(jié)果事半功倍,吉恩特生物的01系列磁珠,半沉降時間可達15min以上,磁吸時間僅為15s左右,可為操作者帶來不一樣的磁珠操作體驗。
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單細胞基因組測序目前主要有兩種擴增方法:MALBAC方法及MDA方法,而單細胞轉(zhuǎn)錄組目前主要有三種方法:SMART擴增技術(shù)、10×genomics技術(shù)及Andeplete技術(shù)。今天主要和大家比較下單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的三種常用方法。