PRM靶向定量蛋白檢測(cè) * 實(shí)驗(yàn)原理

PRM（平行反應(yīng)監(jiān)視，parallel reaction monitoring）是目前靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)的主流方法之一。利用四級(jí)桿質(zhì)量分析器選擇性的檢測(cè)目標(biāo)肽段的母離子信息，隨后在HCD碰撞池中發(fā)碎裂，最后進(jìn)入高分辨率、高質(zhì)量精度的Orbitrap分析器中，檢測(cè)所選擇的母離子窗口內(nèi)的所有碎片離子信息，這樣即可對(duì)復(fù)雜樣本中的目標(biāo)蛋白/肽段進(jìn)行特異性的定量分析。

PRM靶向定量蛋白檢測(cè) * 檢測(cè)流程

PRM靶向定量蛋白檢測(cè) * 技術(shù)應(yīng)用

1、驗(yàn)證高通量定量蛋白質(zhì)組學(xué)（如iTRAQ、TMT、SILAC、Label free）的實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2、對(duì)目標(biāo)蛋白質(zhì)相對(duì)或絕對(duì)定量分析

PRM靶向定量蛋白檢測(cè) * 輝駿服務(wù)優(yōu)勢(shì)

1

十年服務(wù)經(jīng)驗(yàn)，客戶成果發(fā)表在NatureMethods，Oncogene，Cell Research等高水平期刊上。

2

對(duì)蛋白篩選與定量方面有獨(dú)到見解，擅長(zhǎng)針對(duì)客戶情況提出合適的方案建議。

3

自有分子及細(xì)胞生物實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，能有效制定并執(zhí)行最優(yōu)的實(shí)驗(yàn)路線。

4

售后技術(shù)支持將一直保持到客戶發(fā)表文章，確保客戶安心進(jìn)行下游實(shí)驗(yàn)及投稿。

聯(lián)系技術(shù)支持

18927549347

PRM靶向定量蛋白檢測(cè) * 服務(wù)信息

PRM靶向定量蛋白檢測(cè) * 客戶文獻(xiàn)

1. Lisa H.et al: Development of a Parallel Reaction Monitoring Mass Spectrometry Assay for the Detection of SARS-CoV?2 Spike Glycoprotein and Nucleoprotein.Analytical Chemistry.2018，IF=4.402. 【研究?jī)?nèi)容】：研究者采用數(shù)據(jù)獨(dú)立采集(DIA)定量質(zhì)譜法對(duì)20例接受培美曲塞/鉑類化療的晚期肺腺癌患者的血清標(biāo)本進(jìn)行分析，并使用平行反應(yīng)監(jiān)測(cè)(PRM)方法檢測(cè)了20例患者和22例晚期肺腺癌患者的16個(gè)候選血清標(biāo)志物。研究證實(shí)了DIA、MS和PRM相結(jié)合的方法在識(shí)別晚期肺腺癌患者的血清預(yù)測(cè)生物標(biāo)志物方面是有效的。 使用技術(shù)：蛋白組學(xué)prm實(shí)驗(yàn)檢測(cè)、PRM靶向蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)、蛋白組 prm外包公司

2. Clara I.et al: Ethylene Receptors, CTRs and EIN2 Target Protein Identification and Quantification Through Parallel Reaction Monitoring During Tomato Fruit Ripening.Front. Plant Sci.2020，IF=6.785. 【研究?jī)?nèi)容】：研究者為乙烯受體(ETR)及其下游組分CTR和EIN2的鑒定和定量，開發(fā)了一套包括樣品分離和平行反應(yīng)監(jiān)測(cè)結(jié)合質(zhì)譜分析（PRM-MS）的研究方案。以番茄為模式果實(shí)，研究了果實(shí)成熟過(guò)程中乙烯信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)蛋白豐度的變化。研究證實(shí)了鑒定和絕對(duì)定量番茄四個(gè)成熟階段的七個(gè)乙烯受體、四分之三的CTR和EIN2的可行性。 使用技術(shù)：蛋白PRM定量技術(shù)服務(wù)、平行反應(yīng)監(jiān)測(cè)技術(shù)PRM、蛋白定量prm代做

蛋白組/代謝組實(shí)驗(yàn)

? iTRAQ 定量蛋白質(zhì)組學(xué)

? Label Free 實(shí)驗(yàn)檢測(cè)服務(wù)

? LC-MS/MS 蛋白質(zhì)譜鑒定

? DIA 全息掃描定量蛋白質(zhì)
? 廣泛靶向代謝組學(xué)

蛋白/核酸相互作用實(shí)驗(yàn)

? GST pull down

? RNA pull down

? DNA pull down

? Co-IP 免疫共沉淀

? TAP-MS串聯(lián)親和純化

分子細(xì)胞生物學(xué)實(shí)驗(yàn)

? 基因調(diào)取/合成 (cDNA克隆)

?熒光定量PCR (qPCR)

? 載體構(gòu)建實(shí)驗(yàn)服務(wù)

?miRNA靶基因驗(yàn)證
? 慢病毒包裝

科研產(chǎn)品

? 哺乳動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)載體

? 人cDNA克隆庫(kù)

? 慢病毒表達(dá)載體

? 慢病毒干擾載體

抗體工程服務(wù)

? 單克隆抗體測(cè)序

? 抗體從頭測(cè)序

? 抗體表達(dá)服務(wù)

? 重組抗體表達(dá)

實(shí)驗(yàn)試劑盒

? RNA pull down 試劑盒

? GST pull down 試劑盒

? COIP 試劑盒

? Flag 試劑盒

輝駿實(shí)力

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中文標(biāo)題：靶向蛋白質(zhì)組學(xué)在子宮內(nèi)膜癌液體活檢診斷中的作用

發(fā)表期刊：Clinical Cancer Res

影響因子：12.531

運(yùn)用技術(shù)：PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)（由輝駿生物提供技術(shù)支持）

● 內(nèi)容概述

子宮內(nèi)膜癌(EC)的診斷依賴于通過(guò)抽吸獲得的子宮內(nèi)膜活檢組織(即子宮抽吸物)中腫瘤細(xì)胞的觀察，漏檢率達(dá)22%，50%的EC組織分型和級(jí)別被錯(cuò)診?；谶@種現(xiàn)狀，本研究意圖通過(guò)液體活檢檢測(cè)蛋白標(biāo)志物的方式得到一種更加準(zhǔn)確的診斷方式。通過(guò)最新一代的靶向質(zhì)譜采集技術(shù)LC-PRM對(duì)子宮吸出液體的52個(gè)蛋白含量進(jìn)行測(cè)定，在EC組和對(duì)照組以及EC壓型組運(yùn)用邏輯回歸模型對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理，處理結(jié)果顯示MMP9和KPYM兩種蛋白組合能夠有效診斷EC AUC值為0.96，CTNB1、XPO2和CAPG聯(lián)合檢測(cè)能夠有效區(qū)分各壓型，AUC值為0.99。該研究為臨床診斷提供了非常好的候選標(biāo)志物。

● 方法流程

本研究遵循的一般工作流程如圖所示。116例患者的子宮抽吸液處理一式兩份，并在混合四極軌道質(zhì)譜儀上進(jìn)行PRM采集分析。

在每個(gè)樣本中，先前研究(15)中優(yōu)先考慮的52個(gè)候選生物標(biāo)記物的相對(duì)豐度是通過(guò)對(duì)98個(gè)肽的分析來(lái)測(cè)量的。計(jì)算光譜相似性分?jǐn)?shù)以確認(rèn)多肽的同一性并檢測(cè)MS信號(hào)中的干擾。超過(guò)50%的樣本中沒有檢測(cè)到的五個(gè)肽被移除，導(dǎo)致總共有51個(gè)蛋白質(zhì)被93個(gè)肽測(cè)量出來(lái)。通過(guò)重復(fù)樣品制備來(lái)評(píng)價(jià)分析流程的重復(fù)性，98%的檢測(cè)多肽的變異系數(shù)(CV%)低于15%，平均為3.6%。此外，來(lái)自同一蛋白質(zhì)的多肽顯示出高度的相關(guān)性，因此，它們可以互換使用來(lái)評(píng)估蛋白質(zhì)水平。只有三種蛋白(KPYM、OSTP和ROA2)的相關(guān)系數(shù)低于0.85，因?yàn)樗鼈兪怯僧悩?gòu)體特異性多肽監(jiān)測(cè)的。這些多肽被認(rèn)為來(lái)自不同的蛋白質(zhì)。

引用文獻(xiàn)

Elena Martinez-Garcia. et al: Targeted Proteomics Identifies Proteomic Signatures in Liquid Biopsies of the Endometrium to Diagnose Endometrial Cancer and Assist in the Prediction of the Optimal Surgical Treatment. Cancer Res.  2017，IF=12.531.