結(jié)合了抗體的磁珠或樹脂(Beads)與樣本裂解液孵育,通過”抗原-抗體“之間的免疫作用,誘餌蛋白被吸附在Beads上,與此同時,誘餌蛋白的互作蛋白,也一起“共沉淀”到Beads上。洗滌去掉未結(jié)合的蛋白后,再用洗脫緩沖液將互作蛋白復(fù)合物從Beads上洗脫下來,得到免疫共沉淀(Co-IP)產(chǎn)物。Co-IP產(chǎn)物既可以用Western Blot檢測已知蛋白,也可以用質(zhì)譜鑒定未知蛋白。
當(dāng)沒有合適的誘餌蛋白抗體時,還可以通過表達融合了Flag標簽的誘餌蛋白,利用Flag標簽抗體做免疫沉淀。即樣本過表達Flag-Bait,經(jīng)裂解后與anti-Flag珠子孵育,誘餌融合蛋白與Beads結(jié)合,其互作蛋白“共沉淀”到Beads上,再經(jīng)洗滌、洗脫后,用WB或質(zhì)譜檢測。
輝駿生物10年科研服務(wù)經(jīng)驗,專業(yè)提供分子互作實驗服務(wù),包括蛋白與蛋白、蛋白與DNA、蛋白與RNA、RNA與RNA的相互作用技術(shù),經(jīng)驗豐富,實驗結(jié)果穩(wěn)定、可靠。
我公司自有分子、細胞和質(zhì)譜實驗平臺,能執(zhí)行最優(yōu)的實驗路線,對微量互作蛋白的質(zhì)譜鑒定有充足把控力,對后續(xù)功能分析有獨到見解。
我們不僅會提供專業(yè)的售前方案建議、而且售后技術(shù)支持將一直保持到文章發(fā)表,確保您安心進行下游實驗及投稿。
目前,客戶已在Nature子刊、Oncogene、Cell Research等高水平期刊成功發(fā)表大量高分文章(點擊查看客戶文獻)。
內(nèi)源蛋白抗體免疫共沉淀CoIP實驗步驟
標簽抗體免疫共沉淀CoIP實驗流程
蛋白質(zhì)之間相互作用是其發(fā)揮生物學(xué)功能的主要模式,蛋白質(zhì)會通過結(jié)合不同的伙伴來行駛不同的功能,形成復(fù)雜的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)。常見的蛋白互作研究方法主要有:免疫共沉淀(Co-IP)、pull down、酵母雙雜交、熒光雙分子互補(BiFC)、熒光共定位等。這些方法相互補充,通過多種方法共同驗證蛋白質(zhì)間的相互作用,能更大程度的避免假陽性結(jié)果。
Co-IP技術(shù)采用抗體捕獲樣本中的目標蛋白及其互作蛋白復(fù)合物,反應(yīng)的是體內(nèi)真實的生理結(jié)合,但不能顯示這些相互作用是直接還是間接的;另外合適的免疫共沉淀抗體是決定實驗成功的關(guān)鍵,有些蛋白沒有合適的IP抗體,無法進行內(nèi)源性Co-IP實驗;通過構(gòu)建帶標簽的表達載體,使目標蛋白與標簽融合表達,再借助標簽抗體即可完成Co-IP實驗,但需要注意合適的轉(zhuǎn)基因方法又是影響該方法成功的關(guān)鍵。
pull down技術(shù)將目標蛋白進行體外原核表達,使標簽蛋白(GST或His等)與目標蛋白融合表達,借助標簽的親和介質(zhì)將目標蛋白純化出來,可以不受抗體、物種限制,比較輕松的獲得目標蛋白的結(jié)合蛋白,還可以通過外源同時表達目標蛋白和待測蛋白,確定它們是否發(fā)生直接的相互作用,但該方法無法得知體內(nèi)真實的結(jié)合情況。
酵母雙雜交技術(shù)是比較古老的一種技術(shù),將目標蛋白和待測蛋白與GAL4 的兩個結(jié)構(gòu)域BD和AD融合表達,在酵母細胞中,2個蛋白的結(jié)合使得BD和AD在空間上靠近,從而激活報告基因lacZ的表達。但是由于受試蛋白都需要和 AD/BD 結(jié)構(gòu)域形成融合蛋白,空間構(gòu)象可能改變;另外假陽性率也比較高。
熒光雙分子互補(BiFC)技術(shù)將目標蛋白和待測蛋白分別與GFP的兩個片段融合表達,轉(zhuǎn)染細胞后,2個蛋白的結(jié)合使得GFP兩個片段空間上靠近,從而發(fā)出綠色熒光,該技術(shù)觀測直觀,操作簡便,但空間分辨率大約 250nm,對于蛋白質(zhì)相互作用來說依然是個相當(dāng)遠的距離,因此位置上靠近但并未結(jié)合的蛋白也可能顯示陽性結(jié)果,假陽性率較高;另外該技術(shù)可以驗證蛋白間的相互作用,但不能篩選未知互作蛋白。
熒光共定位技術(shù)依靠熒光確定蛋白質(zhì)具有相同定位,用于輔助證明而非直接證明細胞內(nèi)蛋白間的相互作用。
服務(wù)項目 | 服務(wù)內(nèi)容 | 結(jié)果交付 | 實驗周期 | 客戶提供 | 價格 |
Co-IP WB (驗證型) | 樣本質(zhì)檢 (Western blot檢測誘餌蛋白和待測蛋白) | 樣本的誘餌蛋白Western blot檢測圖 樣本的待測蛋白Western blot檢測圖 | 3-4周 | 實驗樣本 誘餌蛋白的IP級抗體 待測蛋白抗體 實驗信息表 | |
Co-IP調(diào)取誘餌蛋白及其互作蛋白 (2組:實驗組、對照組) | IP產(chǎn)物的誘餌蛋白Western blot檢測圖 IP產(chǎn)物的待測蛋白Western blot檢測圖 CoIP實驗報告 | ||||
Co-IP MS (篩選型) | 樣本質(zhì)檢(Western blot檢測誘餌蛋白) | 樣本的誘餌蛋白Western blot檢測圖 | 6-7周 | 實驗樣本 誘餌蛋白的IP級抗體 實驗信息表 | |
Co-IP調(diào)取誘餌蛋白及其互作蛋白 (2組:實驗組、對照組) | IP產(chǎn)物的誘餌蛋白Western blot檢測圖 CoIP實驗服務(wù)報告 | ||||
IP產(chǎn)物的質(zhì)譜檢測及數(shù)據(jù)分析 | 質(zhì)譜(LC-MS/MS)檢測結(jié)果及報告 互作蛋白篩選表格 生物信息學(xué)分析結(jié)果和報告 |
樣本類型 | COIP-WB 建議送樣量 | COIP-MS 建議送樣量 |
動物細胞 | 3*10e7個細胞/組(約3個10cm皿) | 5*10e7個細胞/組(約5個10cm皿) |
動物組織 | 1g/組 | 2g/組 |
植物葉片 | 2g/組 | 4g/組 |
植物根或果實 | 4g/組 | 8g/組 |
菌體 | 50ul菌體沉淀/組 | 100ul菌體沉淀/組 |
▲注意:這里列出的均為每組樣本的送樣量,如果實驗和對照組用的樣本一致,此樣本量*2。詳細送樣指南可聯(lián)系輝駿生物客服或銷售索取。
保存及運輸:-80℃保存,干冰取樣/運輸,至少在送樣前2天通知我司。
Co-IP WB:誘餌蛋白和待測蛋白Western blot檢測圖(陽性)
Co-IP MS:誘餌蛋白Western blot檢測圖
Co-IP MS:質(zhì)譜檢索表格(部分展示)
Co-IP MS:互作蛋白生信分析結(jié)果(部分展示)
Jiang S.Y. et al: Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR through APMAP.
Cancer Research. 2019. (中科院1區(qū),IF=13.312).
轉(zhuǎn)移性前列腺癌具有很高的致命性。已有報道表明,膽固醇與前列腺癌的發(fā)展有關(guān);前期研究發(fā)現(xiàn),膽固醇可以誘導(dǎo)前列腺癌細胞發(fā)生上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT),但其作用及潛在機制尚不清楚。本研究證明膽固醇介導(dǎo)APMAP上調(diào),APMAP通過與EGFR競爭結(jié)合EPS15R,進而抑制EGFR降解,激活ERK1/2通路,促進前列腺癌細胞EMT;提出APMAP可能是一種關(guān)鍵的調(diào)節(jié)劑,為高脂肪飲食、肥胖和癌癥轉(zhuǎn)移之間提供了聯(lián)系。
1. Li H.B. et al: The plant ESCRT component FREE1 shuttles to the nucleus to attenuate abscisic acid signaling. Nature Plants. 2019,IF=17.352. |
2. Jiang, S. et al: Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR through APMAP. Cancer Research.2019,IF= 13.312. |
3. Huang C.Y. et al: UBAP2L arginine methylation by PRMT1 modulates stress granule assembly. Cell Death Differ. 2020 , IF=12.067. |
1. Co-IP WB,用于檢測某樣本中的誘餌蛋白和待測蛋白是否存在相互作用;
2. Co-IP MS,用于篩選某樣本中的誘餌蛋白與哪些蛋白具有相互作用。
Co-IP(免疫共沉淀)檢測服務(wù) | |||||
服務(wù)項目 | 服務(wù)內(nèi)容 | 結(jié)果交付 | 實驗周期 | 客戶提供 | 價格 |
Co-IP WB | Western blot檢測樣本(input)中的誘餌蛋白和待測蛋白 | Western blot檢測圖 | 3-4周 | 1、實驗樣本 2、誘餌蛋白的IP級抗體 3、待測蛋白抗體 4、實驗信息表(樣本信息、抗體信息、誘餌蛋白和待測蛋白序列) | |
Co-IP調(diào)取誘餌蛋白及其互作蛋白 (2組:實驗組、對照組) | CoIP實驗報告 | ||||
Western blot檢測Co-IP產(chǎn)物中的誘餌蛋白和待測蛋白 | Western blot檢測圖 | ||||
Co-IP MS | Western blot檢測樣本(input)中的誘餌蛋白 | Western blot檢測圖 | 5-6周 | 1、實驗樣本 2、誘餌蛋白的IP級抗體 3、實驗信息表(樣本信息、抗體信息、誘餌蛋白序列) | |
Co-IP調(diào)取誘餌蛋白及其互作蛋白 (2組:實驗組、對照組) | CoIP實驗服務(wù)報告 | ||||
Western blot檢測Co-IP產(chǎn)物中的誘餌蛋白 | Western blot檢測圖 | ||||
LC-MS/MS定性檢測Co-IP產(chǎn)物的蛋白、篩選實驗組獨有蛋白(潛在互作蛋白) | 質(zhì)譜檢索表格、互作蛋白篩選表格、檢測報告 | ||||
針對互作蛋白做生物信息學(xué)分析(GO、KEGG pathway、String) | 生物信息學(xué)分析結(jié)果和報告 | 1周 |
1. 送樣量要求
樣本類型 | Co-IP WB 建議送樣量 | Co-IP MS 建議送樣量 |
動物細胞 | 3*10e7個細胞/組(約3個10cm皿) | 5*10e7個細胞/組(約5個10cm皿) |
動物組織 | 1g/組 | 2g/組 |
植物葉片 | 2g/組 | 4g/組 |
植物根或果實 | 4g/組 | 8g/組 |
菌體 | 50ul菌體沉淀/組 | 100ul菌體沉淀/組 |
▲注意:這里列出的均為每組樣本的送樣量,如果實驗和對照組用的樣本一致,此樣本量*2。詳細送樣指南可聯(lián)系輝駿生物客服或銷售索取。
(1)樣本用PBS清洗干凈后,離心去掉液體,先放入液氮中速凍,再轉(zhuǎn)移至-80℃冰箱中保存;
(2)樣本一定要做好標記,應(yīng)用油性防凍記號筆或標簽紙在管上注明樣本名稱或編號;
(3)樣本較多或需要分批做,要將樣本分裝;
(4)干冰取樣/運輸;需要至少在送樣前一天通知我方。
Co-IP WB:誘餌蛋白和待測蛋白Western blot檢測圖(陽性)
Co-IP MS:誘餌蛋白Western blot檢測圖
Co-IP MS:質(zhì)譜檢索表格(部分展示)
1. Li H.B. et al: The plant ESCRT component FREE1 shuttles to the nucleus to attenuate abscisic acid signaling. Nature Plants. 2019,IF=17.352. |
2. Jiang, S. et al: Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR through APMAP. Cancer Research.2019,IF= 13.312. |
3. Huang C.Y. et al: UBAP2L arginine methylation by PRMT1 modulates stress granule assembly. Cell Death Differ. 2020 , IF=12.067. |
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名稱 | 貨號 | 規(guī)格 | 貨期 | 價格 |
動物Co-IP試劑盒(protein A/G磁珠) | FI8802 | 20次/40次 | 現(xiàn)貨 | |
動物Co-IP試劑盒(protein G樹脂) | FI8803 | 20次/40次 | 現(xiàn)貨 | |
植物Co-IP試劑盒(protein A/G磁珠) | FI8812 | 20次/40次 | 現(xiàn)貨 | |
植物Co-IP試劑盒(protein G樹脂) | FI8813 | 20次/40次 | 現(xiàn)貨 |
輝駿生物的免疫共沉淀試劑盒能夠高效完成抗原的免疫沉淀(IP)及免疫共沉淀(Co-IP)實驗。首先,將特異性的抗體加入樣品中與目標抗原形成免疫復(fù)合物,然后將其結(jié)合在protein G或protein A/G beads上。通過漂洗去除未結(jié)合物質(zhì)后,用低 pH 的洗脫液將免疫復(fù)合物從beads上洗脫下來。洗脫的蛋白產(chǎn)物既可以用Western blot檢測已知蛋白,也可以用質(zhì)譜(LC-MS/MS)鑒定未知蛋白。
蛋白-蛋白間的相互作用是蛋白質(zhì)發(fā)揮生物學(xué)功能的主要模式。CO-IP試劑盒采用Protein G或Protein A/G beads來捕獲目標蛋白抗體,進而捕獲樣本中天然結(jié)合的目標蛋白及其互作蛋白。以下列舉了可應(yīng)用CO-IP試劑盒的幾個研究方向:
1. 病毒、細菌等病原體侵染宿主細胞的機制;
2. 酶和底物的作用機制;
3. 天然狀態(tài)下蛋白調(diào)控復(fù)合體的研究。
試劑名稱 | 體積(20 Tests) | 體積(40 Tests) | 保存條件 |
Protein G beads或Protein A/G beads | 850 μL | 1.7 mL | 4 ℃ |
裂解緩沖液 | 11 mL | 22 mL | 4 ℃ |
漂洗液 | 40 mL | 80 mL | 4 ℃ |
洗脫緩沖液 | 1.1 mL | 2.2 mL | 4 ℃ |
蛋白酶抑制劑 | 300 μL | 600 μL | -20 ℃ |
2、裂解效率高:不同優(yōu)化的裂解液配方分別適用于動物、植物樣本。
3、洗脫液適配后續(xù)Western Blot及質(zhì)譜(LC-MS/MS)實驗。
4、操作簡便,耗時短,適用于初學(xué)者。
5、應(yīng)用靈活:可用于任何內(nèi)源性目標蛋白的免疫沉淀或免疫共沉淀實驗。
1. 將細胞裂解液與所選抗體在室溫下孵育 1-2 小時,或 4 ℃ 過夜。
2. 在室溫下,將抗原/抗體復(fù)合物與protein G或ProteinA/G beads結(jié)合 1-2 小時。
3. 漂洗、洗脫得到目標蛋白及其互作蛋白復(fù)合物。
1. Jiang, S. et al: Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR through APMAP. Cancer Research. 2019. IF= 13.312.
2. Huang C.Y. et al: UBAP2L arginine methylation by PRMT1 modulates stress granule assembly. Cell Death Differ. 2020. IF=12.067.
3. Li T. et al: Phosphorylated ATF1 at Thr184 promotes metastasis and regulates MMP2 expression in gastric cancer. J Transl Med. 2022. IF=8.44.
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