抗體是免疫系統(tǒng)的重要組成部分; 對抗感染和疾病以保護身體。 研究此類蛋白質(zhì)的基因組成在幾種不同的應(yīng)用中非常重要,包括抗體工程、數(shù)據(jù)庫、功能優(yōu)化和新抗體克隆的發(fā)現(xiàn)。
可以用稱為雜交瘤技術(shù)的方法對單克隆抗體進行工程改造和選擇。 最初宿主動物被引入抗原 ,導(dǎo)致特定 B 細胞的產(chǎn)生。 幾周后,脾細胞被移除并與骨髓瘤細胞融合。
融合的細胞是永生的,經(jīng)過幾周的孵化,它們最終會產(chǎn)生抗體。 然而,一旦獲得這些抗體,就需要對其進行篩選以確保特異性。 該篩選過程可以通過幾種測序技術(shù)進行,如下所述。
用于鑒定的早期方法核酸抗體序列 之一是 Sanger 測序的小規(guī)模方法。 在 Sanger測序中,樣本 DNA 被分成四個小瓶,其中包含所有四種脫氧核苷酸和DNA聚合酶。
隨著 DNA
在每個小瓶中轉(zhuǎn)錄,然后添加修飾的標記二脫氧核苷三磷酸 (ddNTP),終止 DNA 延伸。 每個小瓶接收不同的 ddNTP,該 ddNTP會停止對不同核苷酸的測序。 然后可以通過電泳分離產(chǎn)生的片段,最終可以通過每個條帶的相對位置來識別 DNA 的序列。
該方法已用于抗體研究等多個行業(yè),并已于 2003 年在人類基因組計劃中用于對第一個人類基因組進行測序。但是,該方法受到限制,因為它非常慢,需要大量的人工工作并且容易出錯。 因此,已經(jīng)開發(fā)了現(xiàn)代方法來提高測序的通量和可靠性。
新一代測序技術(shù)是鑒定 DNA 核酸序列的現(xiàn)代方法。使用熒光標記的 dNTP 可以更快地獲得結(jié)果,同時對數(shù)千個片段進行測序。涉及四個主要階段:
●文庫制備 :DNA 樣本被片段化,并在每一端添加接頭。
●簇擴增 :片段與流動槽表面雜交并倍增。
●測序 :將 試劑 添加到樣品中,然后開始測序。當(dāng)熒光標記的抗體被摻入時,它們會釋放特定波長的發(fā)射。
●分析 :通過生物信息學(xué)軟件從獲得的數(shù)據(jù)中推斷出DNA的序列。
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