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來自西奈山伊坎醫(yī)學院的研究人員與美國國立衛(wèi)生研究院臨床蛋白質組腫瘤分析聯(lián)盟，德克薩斯大學醫(yī)學博士安德森癌癥中心，邁阿密大學米勒醫(yī)學院的西爾維斯特綜合癌癥中心等合作，揭示了對癌癥免疫反應的詳細了解，標志著該領域的重大發(fā)展。研究結果發(fā)表在2月14日的Cell在線雜志上。

該研究利用了10種不同癌癥的1,000多個腫瘤的數(shù)據，首次整合了DNA、RNA和蛋白質組學（蛋白質研究），揭示了腫瘤中免疫細胞的復雜相互作用。這些數(shù)據來自臨床蛋白質組腫瘤分析聯(lián)盟（CPTAC），這是美國國家癌癥研究所的一個項目。

每種類型的免疫反應都與基因功能的變化有關，例如基因如何被修飾，它們發(fā)出的信息以及它們產生的蛋白質。通過提供癌癥免疫反應的全面分子指紋，這項研究有望促進未來免疫治療策略的發(fā)展。

一個關鍵的發(fā)現(xiàn)是，在通過先進的統(tǒng)計模型確定的七種亞型中，有五種包括來自十種不同類型癌癥的腫瘤，這表明這些腫瘤之間存在共同的免疫反應。當我們在同一免疫組內的各種癌癥中看到共同的免疫反應和細胞行為方式的相似模式時，它暗示某些增強免疫系統(tǒng)的治療方法可以很好地用于許多類型的癌癥。

這項研究的一個新方面源于1,000多個腫瘤產生的深度磷酸蛋白組學數(shù)據。這些數(shù)據使研究人員能夠了解蛋白質是如何被修飾的?！巴ㄟ^對1,000多種泛癌腫瘤的磷酸化蛋白質組學分析，科研人員能夠通過計算發(fā)現(xiàn)一系列關鍵的新型藥物靶點。通過用小分子或其他手段靶向選定的激酶，可能將對免疫療法沒有反應的腫瘤轉化為具有更好免疫療法反應的腫瘤。

作為研究的一部分，應用于數(shù)字病理學圖像的機器學習工具也證明了不同類型的免疫反應與某些免疫細胞的存在之間的相關性，從而增強了對腫瘤內部和周圍環(huán)境的理解。

接下來，研究人員計劃進一步驗證他們的發(fā)現(xiàn)，并利用正在進行的免疫治療臨床研究的見解。這項工作旨在簡化治療反應的生物標志物小組的開發(fā)，并確定增強的治療策略。

蛋白組/代謝組實驗

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蛋白/核酸相互作用實驗

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