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空間基因組學(xué)是一個(gè)前沿領(lǐng)域，它結(jié)合了基因組學(xué)和空間分析，以單細(xì)胞分辨率研究基因組特征在疾病中的作用。

空間基因組學(xué)是一個(gè)研究領(lǐng)域，重點(diǎn)是分析完整組織內(nèi)基因組特征的空間組織。它涉及通過(guò)轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析和其空間背景內(nèi)的表觀遺傳修飾來(lái)同時(shí)分析各種分子組分，包括基因組DNA和RNA。這些技術(shù)旨在揭示不同基因組元件之間的空間關(guān)系，并提供對(duì)組織內(nèi)單細(xì)胞的組織和功能的見(jiàn)解，從而使特定基因型與其表型之間的分子聯(lián)系成為可能。

癌癥研究從這些方法中受益匪淺。癌癥基因組以單核苷酸多態(tài)性（SNP）或結(jié)構(gòu)變異（如較大基因組區(qū)域上的拷貝數(shù)改變（CNA））的形式表現(xiàn)出高水平的多樣性。大多數(shù)SNP和/或CNA存在于基因組的非編碼區(qū)，它們以癌癥特異性方式影響癌基因和/或腫瘤抑制因子的調(diào)節(jié)。

這種疾病的另一個(gè)共同特征是在疾病進(jìn)展期間非編碼驅(qū)動(dòng)突變的積累，引起基因組不穩(wěn)定性和腫瘤發(fā)展。在這種情況下，空間基因組學(xué)可以提供有關(guān)這些非編碼變化的影響的信息，以及也可能影響染色質(zhì)組織的表觀遺傳修飾，促進(jìn)癌癥的發(fā)展。

一些空間多組學(xué)技術(shù)也已發(fā)展，最常見(jiàn)的方法是空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的整合。然而，有一種新的方法用于共映射轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組，允許在同一組織切片中研究染色質(zhì)可及性，組蛋白修飾和mRNA表達(dá)。這些技術(shù)已被應(yīng)用于小鼠和人腦樣本，提供了寶貴的見(jiàn)解表觀遺傳和組織內(nèi)的轉(zhuǎn)錄動(dòng)力學(xué)。

單小區(qū)技術(shù)（例如，scRNA-seq）是用于分析單個(gè)細(xì)胞中基因表達(dá)的有價(jià)值的技術(shù)。通過(guò)捕獲單細(xì)胞群體的轉(zhuǎn)錄組，scRNA-seq能夠在詳細(xì)水平上探索基因型-表型關(guān)系。這些方法已經(jīng)與空間生物學(xué)合并，通過(guò)以細(xì)胞分辨率識(shí)別組織的空間組織來(lái)實(shí)現(xiàn)更高級(jí)別的復(fù)雜性。Spatial Genomics的GenePS就是利用這種單細(xì)胞空間分析的新技術(shù)的一個(gè)例子。

空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)已成為表征腫瘤微環(huán)境的癌癥研究中最重要的技術(shù)之一。它有效地分析了完整腫瘤樣本中的各種細(xì)胞類(lèi)型和狀態(tài)，并對(duì)空間異質(zhì)性產(chǎn)生了有價(jià)值的見(jiàn)解。創(chuàng)新的方法，包括固相捕獲方法，如10X Visium，已被用于分析不同腫瘤類(lèi)型的腫瘤微環(huán)境。

這些技術(shù)提供了更高的通量，是理想的翻譯應(yīng)用，通過(guò)組織病理學(xué)和NGS方法的組合。耦合的組織學(xué)和空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)也被用于訓(xùn)練機(jī)器學(xué)習(xí)算法，旨在預(yù)測(cè)乳腺癌中的組織病理學(xué)注釋和局部基因表達(dá)。此外，Slide-Seq和高清晰度空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)（HDST）已在冷凍保存的Her 2+乳腺癌標(biāo)本中有效地繪制了單細(xì)胞水平的基因表達(dá)。

科研產(chǎn)品

? 哺乳動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)載體

? 人cDNA克隆庫(kù)

? 慢病毒表達(dá)載體

? 慢病毒干擾載體

抗體工程服務(wù)

? 單克隆抗體測(cè)序

? 抗體從頭測(cè)序

? 抗體表達(dá)服務(wù)

? 重組抗體表達(dá)

實(shí)驗(yàn)試劑盒

? RNA pull down 試劑盒

? GST pull down 試劑盒

? COIP 試劑盒

? Flag 試劑盒