ChIP-seq 是染色質(zhì)免疫沉淀測序的縮寫。從根本上說,ChIP-seq 是對與正在研究的 DNA 結(jié)合蛋白共沉淀的基因組 DNA 片段進(jìn)行測序。以這種方式最常研究的 DNA
結(jié)合蛋白是轉(zhuǎn)錄因子(例如,p53 或 NFκB)、染色質(zhì)修飾酶(例如,p300、組蛋白去乙酰化酶)、與基因組 DNA
相互作用的修飾組蛋白(例如,組蛋白 3 三甲基化賴氨酸 4)和基礎(chǔ)轉(zhuǎn)錄機(jī)制的組成部分(例如,RNA 聚合酶 II)。從理論上講,該技術(shù)可以以公正的方式識別基因組中與特定 DNA 結(jié)合蛋白物理相關(guān)的所有 DNA 片段。 我們說“不偏不倚”是因為免疫沉淀中的任何
DNA 都會被測序,因此該技術(shù)不依賴于對精確 DNA 結(jié)合位點(diǎn)的先驗知識。
1. ChIP qPCR,用于檢測某樣本中的誘餌蛋白和待測DNA片段是否結(jié)合;
2. ChIP seq,用于篩選某樣本中的誘餌蛋白可以結(jié)合哪些DNA區(qū)域。
ChIP(染色質(zhì)免疫共沉淀)檢測服務(wù) | |||||
服務(wù)項目 | 服務(wù)內(nèi)容 | 結(jié)果交付 | 實(shí)驗周期 | 客戶提供 | 價格 |
ChIP qPCR | Western blot檢測樣本(input)中的誘餌蛋白 | Western blot檢測圖 | 5-6周 | 實(shí)驗樣本 誘餌蛋白的IP級抗體 實(shí)驗信息表(樣本信息,誘餌蛋白及待測DNA序列) | |
ChIP調(diào)取誘餌蛋白及其結(jié)合的DNA片段 (2組:實(shí)驗組和對照組) | ChIP實(shí)驗報告 | ||||
Western blot檢測ChIP產(chǎn)物中的誘餌蛋白 | Western blot檢測圖 | ||||
qPCR檢測ChIP產(chǎn)物中的待測DNA片段 | qPCR檢測數(shù)據(jù) | ||||
ChIP seq | Western blot檢測樣本(input)中的誘餌蛋白 | Western blot檢測圖 | 5-6周 | 實(shí)驗樣本 誘餌蛋白的IP級抗體 實(shí)驗信息表(樣本信息,誘餌蛋白序列) | |
ChIP調(diào)取誘餌蛋白及其結(jié)合的DNA片段 (2組:實(shí)驗組和對照組) | ChIP實(shí)驗報告 | ||||
Western blot檢測ChIP產(chǎn)物中的誘餌蛋白 | Western blot檢測圖 | ||||
seq檢測ChIP產(chǎn)物中的DNA片段并分析 | seq檢測結(jié)果、檢測和分析報告 | 9周 |
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