蛋白質(zhì)測(cè)序主要是依靠化學(xué)或酶消化的方法來(lái)分離多肽并檢測(cè)氨基酸殘基的數(shù)量和組成,這篇文章將介紹蛋白質(zhì)測(cè)序的原理和實(shí)驗(yàn)步驟。
目前,所謂的蛋白質(zhì)測(cè)序是指檢測(cè)蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu),其包含蛋白質(zhì)中多肽鏈的數(shù)量。多肽和蛋白質(zhì)可在許多情況下同等使用。多肽的氨基酸序列是蛋白質(zhì)的生物學(xué)功能。
蛋白質(zhì)分子必須經(jīng)過(guò)分離純化。幾種多肽通過(guò)非共價(jià)鍵結(jié)合在一起,稱為寡聚蛋白。比如用8 mol/L尿素或6 mol/ L鹽酸胍處理四聚體-血紅蛋白和二聚體-烯醇化酶。
多肽的數(shù)目可通過(guò)檢測(cè)氨基酸殘基的摩爾數(shù)與蛋白質(zhì)分子量之間的關(guān)系來(lái)確定。
幾條多肽鏈通過(guò)二硫鍵連接。在8 mol/ L尿素或6 mol/ L鹽酸胍條件下,過(guò)量的[β]巰基乙醇將二硫鍵還原為硫醇。然后用烷基試劑保護(hù),防止再氧化。
裂解和保護(hù)二硫鍵
A. 過(guò)甲酸:-CH2SO3H
B. 還原+氧化:巰基乙醇,DTT +碘乙酸,-S-CH 2-COOH
C. 亞硫酸分解:-R1-S-S-R2 + HSO3-,R1-S- + R2-S-SOH3
多肽的氨基酸分為兩類:氨基末端和羧基末端。在肽鏈氨基酸序列分析中,N端比C端更為重要。
通常,胃蛋白酶將用于處理具有二硫鍵的那些多肽鏈。然后用二維電泳技術(shù)分離每個(gè)肽段。分析可能含有二硫鍵的肽段的組成和序列。然后將其與其它方法分析的肽片段進(jìn)行比較,確定二硫鍵的位置。
輝駿生物基于高精度、高分辨率質(zhì)譜設(shè)備,結(jié)合自主研發(fā)的測(cè)序技術(shù)平臺(tái),能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)目標(biāo)蛋白氨基酸序列的精準(zhǔn)解讀。該技術(shù)可以用于解析任何純蛋白樣本,比如工具酶、突變蛋白、單克隆抗體等。
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