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客戶文章技術(shù)專題問題答疑
互作實(shí)驗(yàn)蛋白實(shí)驗(yàn)分子細(xì)胞實(shí)驗(yàn)
免疫共沉淀(CoIP)與免疫沉淀(IP)有何區(qū)別 ?

您是否對(duì)免疫沉淀CoIP和免疫共沉淀IP之間的差異感到困惑?這兩種技術(shù)表面上看起來很相似,但它們?cè)趹?yīng)用和實(shí)驗(yàn)設(shè)置上存在分歧。免疫沉淀涉及從樣品中分離靶蛋白質(zhì)與其他蛋白質(zhì)的混合物。它利用抗體來固定特定的蛋白質(zhì)。另一方面,免疫共沉淀使研究人員能夠識(shí)別和表征蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)的相互作用,使其更上一層樓。這項(xiàng)技術(shù)旨在從復(fù)雜的混合物中挖掘出目標(biāo)蛋白及其伙伴蛋白,為它們的整合功能提供重要的見解??傊?,雖然免疫沉淀分離特定的感興趣的蛋白質(zhì),但免疫共沉淀深入研究樣品內(nèi)蛋白質(zhì)相互作用的動(dòng)態(tài)網(wǎng)絡(luò)。


實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)

免疫沉淀和免疫共沉淀之間的二分法植根于實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的細(xì)節(jié)。免疫沉淀需要明智地使用特異性抗體以從蛋白質(zhì)的復(fù)雜混合物中提取目標(biāo)蛋白質(zhì)。最重要的抗體鎖存到所需的蛋白質(zhì)上,產(chǎn)生有趣的抗原-抗體復(fù)合物的形成,然后使其沉淀,通常利用蛋白質(zhì)A/G珠或類似的技術(shù)。這一多方面的魔法在其確保目標(biāo)蛋白質(zhì)的純化和濃縮以用于下游分析的能力方面是無與倫比的。


在這個(gè)復(fù)雜的硬幣的另一面是免疫共沉淀。這種方法將感興趣的蛋白質(zhì)及其相互作用的伴侶一起并以一定的技巧拋到聚光燈下。為了實(shí)現(xiàn)這一點(diǎn),抗體(當(dāng)然)被部署,其全神貫注地專注于感興趣的蛋白質(zhì)。這種大膽的方法旨在捕獲感興趣的蛋白質(zhì)及其靈巧的隨從時(shí),研究它們?cè)趶?fù)合物中的相互作用。這種復(fù)雜的生物學(xué)作用網(wǎng)絡(luò)需要尖端技術(shù),而免疫共沉淀是最有效的方法之一。


應(yīng)用領(lǐng)域

IP免疫沉淀的科學(xué)技術(shù)是一種高度有效的方法,主要用于從復(fù)雜混合物中分離和純化特定的感興趣蛋白質(zhì)。這種廣泛使用的方法提供了大量有價(jià)值的見解蛋白質(zhì)研究的不同方面,如蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),功能,翻譯后修飾,和蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)的相互作用。通過使用免疫沉淀作為工具,研究人員可以研究特定蛋白質(zhì)在給定樣品中的存在和分布,以及其生化特性。


然而,對(duì)于蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的研究,通常采用稱為免疫共沉淀的更先進(jìn)和復(fù)雜的方法。該技術(shù)專門設(shè)計(jì)用于鑒定和分離與靶蛋白相互作用的蛋白質(zhì),提供對(duì)復(fù)合物內(nèi)蛋白質(zhì)的功能關(guān)系、動(dòng)力學(xué)和組成的核心見解。此外,從co-IP收集的信息對(duì)于分析信號(hào)通路、研究蛋白質(zhì)復(fù)合物以及探索與蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用相關(guān)的復(fù)雜生物過程是非常寶貴的。因此,免疫共沉淀是蛋白質(zhì)研究領(lǐng)域中的重要工具,提供了對(duì)生物過程的潛在機(jī)制和復(fù)雜性的更好的理解。


目標(biāo)選擇

在免疫沉淀的復(fù)雜世界中,靶蛋白的選擇是決定研究成敗的關(guān)鍵步驟。它需要科學(xué)悟性、戰(zhàn)略思維以及對(duì)所研究蛋白質(zhì)生物學(xué)功能的深刻理解相結(jié)合。通常,研究人員會(huì)仔細(xì)研究大量數(shù)據(jù),尋找蛋白質(zhì)相互作用的線索,與研究問題的相關(guān)性,以及其他特定標(biāo)準(zhǔn),以確保分離出感興趣的單個(gè)蛋白質(zhì)。


但對(duì)知識(shí)的追求并不止于此。進(jìn)入免疫共沉淀co-ip,一種將目標(biāo)選擇提升到一個(gè)全新的水平的技術(shù)。這種方法將焦點(diǎn)擴(kuò)展到單個(gè)蛋白質(zhì)之外,鼓勵(lì)對(duì)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用進(jìn)行更廣泛的研究,這些相互作用對(duì)我們理解復(fù)雜生物系統(tǒng)至關(guān)重要。通過捕獲靶蛋白及其相互作用的伴侶,研究人員可以更深入地研究這些關(guān)系的錯(cuò)綜復(fù)雜,并揭示構(gòu)成這個(gè)非凡網(wǎng)絡(luò)的復(fù)雜組成部分。


下游分析

IP和COIP之后可以進(jìn)行各種下游分析,例如蛋白質(zhì)印跡、質(zhì)譜或功能測(cè)定。然而,下游分析的選擇可能取決于實(shí)驗(yàn)的具體目標(biāo)而不同。免疫沉淀之后通常是如蛋白質(zhì)印跡的技術(shù)以驗(yàn)證靶蛋白的存在和純度。它也可以用于蛋白質(zhì)定量或檢測(cè)特定的翻譯后修飾。另一方面,免疫共沉淀經(jīng)常與質(zhì)譜等技術(shù)結(jié)合,以鑒定蛋白質(zhì)復(fù)合物內(nèi)的相互作用伴侶。這種方法提供了一個(gè)更廣泛的觀點(diǎn),蛋白質(zhì)相互作用,并允許復(fù)雜的組合物和動(dòng)力學(xué)的表征。


總之,免疫沉淀和免疫共沉淀是蛋白質(zhì)研究中有價(jià)值的技術(shù),但它們?cè)趯?shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、應(yīng)用、靶點(diǎn)選擇和下游分析方面有所不同。免疫沉淀主要集中在特定蛋白質(zhì)的分離和純化,而免疫共沉淀的目的是捕獲蛋白質(zhì)復(fù)合物并研究蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。了解這些技術(shù)之間的差異可以讓研究人員根據(jù)他們的研究目標(biāo)和實(shí)驗(yàn)需求選擇最合適的方法。



免疫共沉淀(Co-IP)實(shí)驗(yàn)流程-輝駿生物


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標(biāo)簽抗體免疫共沉淀CoIP實(shí)驗(yàn)流程



輝駿生物提供的Co-IP免疫共沉淀技術(shù)服務(wù)分為以下兩種:

1. Co-IP WB,用于檢測(cè)某樣本中的誘餌蛋白和待測(cè)蛋白是否存在相互作用;

2. Co-IP MS,用于篩選某樣本中的誘餌蛋白與哪些蛋白具有相互作用。

服務(wù)項(xiàng)目
服務(wù)內(nèi)容結(jié)果交付實(shí)驗(yàn)周期客戶提供
價(jià)格

Co-IP WB

(驗(yàn)證型)

樣本中誘餌蛋白和待測(cè)蛋白的Western blot檢測(cè)Western blot檢測(cè)圖4-5周

實(shí)驗(yàn)樣本

誘餌蛋白的IP級(jí)抗體

待測(cè)蛋白抗體

實(shí)驗(yàn)信息表


點(diǎn)擊詢價(jià)


Co-IP調(diào)取誘餌蛋白及其互作蛋白

(2組:實(shí)驗(yàn)組、對(duì)照組)

CoIP實(shí)驗(yàn)報(bào)告

誘餌蛋白Western blot檢測(cè)圖

待測(cè)蛋白Western blot檢測(cè)圖

Co-IP MS

(篩選型)

樣本中誘餌蛋白的Western blot檢測(cè)Western blot檢測(cè)圖7-8周

實(shí)驗(yàn)樣本

誘餌蛋白的IP級(jí)抗體

實(shí)驗(yàn)信息表



點(diǎn)擊詢價(jià)



Co-IP調(diào)取誘餌蛋白及其互作蛋白

(2組:實(shí)驗(yàn)組、對(duì)照組)

CoIP實(shí)驗(yàn)服務(wù)報(bào)告

誘餌蛋白Western blot檢測(cè)圖

LC-MS/MS檢測(cè)及數(shù)據(jù)分析

質(zhì)譜檢測(cè)結(jié)果及報(bào)

告互作蛋白篩選表格

生物信息學(xué)分析結(jié)果和報(bào)告



免疫共沉淀Co-IP實(shí)驗(yàn)服務(wù)案例—客戶文章解析


Jiang S.Y. et al: Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR through APMAP.

 Cancer Research. 2019. (中科院1區(qū),IF=13.312).


膽固醇通過APMAP抑制EGFR降解誘導(dǎo)前列腺癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移



研究概述

轉(zhuǎn)移性前列腺癌具有很高的致命性。已有報(bào)道表明,膽固醇與前列腺癌的發(fā)展有關(guān);前期研究發(fā)現(xiàn),膽固醇可以誘導(dǎo)前列腺癌細(xì)胞發(fā)生上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT),但其作用及潛在機(jī)制尚不清楚。本研究證明膽固醇介導(dǎo)APMAP上調(diào),APMAP通過與EGFR競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合EPS15R,進(jìn)而抑制EGFR降解,激活ERK1/2通路,促進(jìn)前列腺癌細(xì)胞EMT;提出APMAP可能是一種關(guān)鍵的調(diào)節(jié)劑,為高脂肪飲食、肥胖和癌癥轉(zhuǎn)移之間提供了聯(lián)系。


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研究路線


細(xì)胞功能實(shí)驗(yàn)證實(shí)膽醇誘導(dǎo)前列腺癌細(xì)胞EMT的發(fā)生依賴于ERK1/2的激活
RNA-seq、蛋白組學(xué)等實(shí)驗(yàn)篩選和驗(yàn)證與膽固醇有關(guān)的差異基因和蛋白,確定ERK1/2的上游凋節(jié)因子“ APMAI和“"EGFR”作為后續(xù)研究目標(biāo)
APMAP基因敵除后的RNA-seq結(jié)果及其細(xì)胞實(shí)驗(yàn)均顯示APMAP和膽固醇可能有相似的功能
APMAP和EGFR的表達(dá)關(guān)系實(shí)驗(yàn)表明 APMAP通過調(diào)節(jié)EGFR參與膽固醇誘導(dǎo)的EMT過程
免疫共沉淀Co-IP結(jié)合質(zhì)譜實(shí)驗(yàn)找到 APMAP的互作蛋白EPS15R
免疫熒光結(jié)果顯示膽固醇誘導(dǎo)使EPS15R和APMAP的作用增強(qiáng),EPS15R與EGFR解離,進(jìn)而抑制EGFR降解
臨床樣本分析APMAP與前列腺癌的關(guān)系




免疫共沉淀coip實(shí)驗(yàn)—輝駿生物高分客戶文章


1. Li H.B. et al: The plant ESCRT component FREE1 shuttles to the nucleus to attenuate abscisic acid signaling. Nature Plants. 2019,IF=17.352.
【研究?jī)?nèi)容】:客戶發(fā)現(xiàn),作為內(nèi)體蛋白分選轉(zhuǎn)運(yùn)復(fù)合體成分之一的FREE1基因,受到脫落酸刺激時(shí)候會(huì)發(fā)生磷酸化并移位到細(xì)胞核??蛻衾媒湍鸽p雜交技術(shù)找到兩個(gè)核蛋白ABF4 and ABI5會(huì)與FREE1結(jié)合,免疫共沉淀CoIP實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步證實(shí)了FREE與這兩個(gè)蛋白的互作。后續(xù)實(shí)驗(yàn)表明,F(xiàn)REE1通過抑制ABF4、ABI5對(duì)下游基因的調(diào)控能力,參與了脫落酸信號(hào)通路。
使用相關(guān)技術(shù):質(zhì)譜鑒定、免疫共沉淀co-ip、Co-IP MS實(shí)驗(yàn)


2. Jiang, S. et al: Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR through APMAP. Cancer Research.2019,IF= 13.312.
【研究?jī)?nèi)容】:客戶利用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),篩選出膽固醇致前列腺癌發(fā)生上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)變(EMT)的重要基因APMAP和EGFR。通過在前列腺癌細(xì)胞表達(dá)3*Flag-APMAP基因,并利用免疫共沉淀CoIP及質(zhì)譜鑒定技術(shù),客戶發(fā)現(xiàn)EPS15R可與APMAP結(jié)合。進(jìn)一步的研究證實(shí),體內(nèi)EPS15R-APMAP復(fù)合物通過EGFR致使細(xì)胞發(fā)生EMT。
使用相關(guān)技術(shù):蛋白質(zhì)組學(xué)、質(zhì)譜鑒定、免疫共沉淀CoIP


3. Huang C.Y. et al: UBAP2L arginine methylation by PRMT1 modulates stress granule assembly. Cell Death Differ. 2020 , IF=12.067.
【研究?jī)?nèi)容】:前期研究表明UBAP2L蛋白參與應(yīng)激顆粒形成??蛻粼谶@項(xiàng)研究中,用免疫共沉淀結(jié)合質(zhì)譜等技術(shù),發(fā)現(xiàn)PRMT1甲基化UBAP2L,UBAP2L蛋白并且和另外三個(gè)應(yīng)激顆粒形成有關(guān)的重要蛋白有相互作用。這些蛋白復(fù)合物介導(dǎo)了應(yīng)激顆粒的形成。
使用相關(guān)技術(shù):coip技術(shù)服務(wù)、質(zhì)譜鑒定、修飾位點(diǎn)鑒定



CoIP實(shí)驗(yàn)技術(shù)外包—輝駿服務(wù)優(yōu)勢(shì)

1. 近十年服務(wù)經(jīng)驗(yàn),服務(wù)客戶眾多,案例發(fā)表在Nature Cell Biology、Nature Plants、Cancer Research等知名期刊上。

2. 對(duì)蛋白互作的篩選鑒定理解深刻,擅長(zhǎng)針對(duì)客戶具體情況提出合適的方案建議。

3. 自有分子及細(xì)胞生物實(shí)驗(yàn)平臺(tái),能有效制定并執(zhí)行最優(yōu)的實(shí)驗(yàn)路線。

4. 自有蛋白質(zhì)組學(xué)平臺(tái),對(duì)微量CoIP實(shí)驗(yàn)產(chǎn)物的質(zhì)譜鑒定有十足的把控能力,對(duì)后續(xù)的生物信息分析有獨(dú)到的見解。

5. 售后技術(shù)支持將一直保持到客戶發(fā)表文章,確??蛻舭残拿庖吖渤恋硐掠螌?shí)驗(yàn)及投稿。


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