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1. 從純化方式來看：采用ProteinA/G純化的多抗摻雜有動物本身產(chǎn)生的對其自身抗原產(chǎn)生的抗體，這些抗體在檢測中會識別樣本中的蛋白而出現(xiàn)雜帶，可采用抗原親和純化避免雜帶的產(chǎn)生。
2. 從蛋白修飾來看：天然蛋白存在復(fù)雜的翻譯后修飾。這點可以通過信息學(xué)分析進(jìn)行解釋。
3. 從蛋白翻譯后加工來看：翻譯后蛋白前體經(jīng)切割可能會使部分蛋白分子量偏小，而天然組織中同時存在蛋白前體和切割加工后的蛋白，二者序列有相同部分，可能會產(chǎn)生雜帶。這點需要通過查閱與目的蛋白相關(guān)文獻(xiàn)進(jìn)行了解。
4. 從同源家族蛋白來看：當(dāng)目的蛋白有同源家族蛋白時，蛋白異構(gòu)體的存在可能會使分子量偏離預(yù)測分子量，因為天然樣本中由同一個mRNA不同的剪接方式進(jìn)行翻譯形成的蛋白產(chǎn)物也會有相同的抗原表位，同時被抗體識別時會產(chǎn)生雜帶。
5. 從蛋白聚集形式來看：蛋白多聚體的形成，雖然還原條件可以抑制多聚體的形成，但是強(qiáng)烈的蛋白間相互作用在還原條件下也有可能不解聚導(dǎo)致條帶偏大。