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客戶文章技術(shù)專題問題答疑
互作實(shí)驗(yàn)蛋白實(shí)驗(yàn)分子細(xì)胞實(shí)驗(yàn)
TMT標(biāo)記定量實(shí)驗(yàn)原理及實(shí)驗(yàn)流程是怎樣的?

TMT實(shí)驗(yàn)原理

Tandem Mass Tag? (TMT?) 是由美國Thermo公司研發(fā)的體外同重同位素標(biāo)記的定量技術(shù)的專利產(chǎn)品,用于標(biāo)記不同的蛋白樣品并同時(shí)進(jìn)行高通量的 LC-MS/MS 的定量研究 。目前有 2-、6-、10- 等 3種通量類型,可分別平行處理 2個(gè)、6個(gè)和 10個(gè)樣品,顯著提高了蛋白樣品質(zhì)譜檢測(cè)的通量,減少所需質(zhì)譜機(jī)時(shí);此外,由于采用了穩(wěn)定同位素標(biāo)記不同樣品,在標(biāo)記實(shí)驗(yàn)之后所有樣品混合成一個(gè)進(jìn)行后續(xù)處理,大大降低了實(shí)驗(yàn)誤差,使得定量準(zhǔn)確性顯著提高。


TMT同位素試劑標(biāo)記多肽氨基基團(tuán)后,等量混勻多肽并進(jìn)行LC-MS/MS分析。一級(jí)質(zhì)譜中,不同樣品來源的同一肽段表現(xiàn)出相同的m/Z;二級(jí)質(zhì)譜中,化學(xué)鍵斷裂釋放出報(bào)告離子,低質(zhì)量區(qū)的報(bào)告離子強(qiáng)度反映了該肽段在不同樣品中的相對(duì)表達(dá)量,高質(zhì)量區(qū)的肽段碎片離子m/Z反映了該肽段的序列信息。質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)經(jīng)過數(shù)據(jù)庫檢索,即可得到樣本中所含蛋白及其表達(dá)差異。


TMT標(biāo)記定量實(shí)驗(yàn)流程

2-、6-、10-個(gè)樣品分別提取總蛋白,取等量蛋白進(jìn)行 Trypsin 酶切,得到相應(yīng)樣品的多肽;分別用不同的 TMT 標(biāo)簽對(duì) 2-、6-、10- 個(gè)樣品進(jìn)行標(biāo)記,隨后等量混合成一個(gè)樣品并進(jìn)行LC-MS/MS 分析和后續(xù)的數(shù)據(jù)庫比對(duì),鑒定出樣品中含有哪些蛋白以及每個(gè)蛋白在樣品中相對(duì)含量。


輝駿生物TMT實(shí)驗(yàn)流程圖

圖1:輝駿生物TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)流程圖



輝駿生物擁有10多年專業(yè)的TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)經(jīng)驗(yàn),公司自有蛋白質(zhì)組學(xué)平臺(tái)大大降低TMT蛋白質(zhì)組學(xué)檢測(cè)價(jià)格費(fèi)用,實(shí)驗(yàn)外包數(shù)據(jù)真實(shí)可信,眾多客戶已在Nature methods、Annals of the rheumatic diseases,Journal of Hematology & Oncology等高水平期刊發(fā)表IF>10等優(yōu)質(zhì)高分論文!



輝駿生物TMT技術(shù)服務(wù)優(yōu)勢(shì)


1

高通量: 16-plex TMT試劑盒可同時(shí)標(biāo)記最多 16組樣本

2

適用范圍廣:幾乎可對(duì)任何物種的各類蛋白質(zhì)進(jìn)行分離鑒定,不受蛋白大小或酸堿性等因素影響


3

靈敏度高:低豐度蛋白也能檢出


4

定量準(zhǔn)確:不同標(biāo)記的肽段等量混合后上機(jī),避免技術(shù)誤差,提高檢測(cè)效率





TMT應(yīng)用領(lǐng)域


基礎(chǔ)醫(yī)學(xué):疾病標(biāo)志物,發(fā)病機(jī)制,疾病分型等;

生物醫(yī)藥:藥物機(jī)理,藥效評(píng)價(jià),藥物開發(fā)等;

農(nóng)林畜漁:抗逆脅迫,生長發(fā)育,耐藥,致病機(jī)理等。



TMT服務(wù)信息-輝駿生物


項(xiàng)目名稱

客戶提供

結(jié)果交付

實(shí)驗(yàn)周期

價(jià)格

iTRAQ/TMT

原始樣本(干冰運(yùn)輸,廣州地區(qū)可上門取樣)
樣本信息表
分析要求

       

 1、蛋白鑒定及定量結(jié)果表
 2、肽段鑒定及定量結(jié)果表
 3、差異蛋白結(jié)果表
 4、生物信息學(xué)分析結(jié)果
 5、質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)
 6、實(shí)驗(yàn)報(bào)告

5-7周


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生物信息學(xué)分析-輝駿生物



TMT標(biāo)記定量—輝駿生物客戶發(fā)表文獻(xiàn)


1. Li K. et al: Tyrosine kinase Fyn promotes osteoarthritis by activating the β-catenin pathway. Ann Rheum Dis, 0:1–9 (2018,IF=14.299).

2. Global iTRAQ-based proteomic profiling of Toxoplasma gondii oocysts during sporulation. J Proteomics.(2016 , IF=5.168).

3. Comparative Proteomics Analysis of Bacillus amyloliquefaciens SQR9 Revealed the Key Proteins Involved in in Situ Root Colonization. J Proteome Res.(2014 , IF=4.173).

4. Zeng L. et al: Asparagine Synthetase and Filamin A Have Different Roles in Ovarian Cancer. Front Oncol. (2019,IF=4.848).



輝駿實(shí)力


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