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「輝駿客戶文章」Cancer Research| Co-IP MS技術(shù)篩選APMAP在前列腺癌中的新作用因子
發(fā)布時間:2019-05-16 14:26:16作者:輝駿生物

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背景:
轉(zhuǎn)移性前列腺癌具有很高的致命性。已有報道表明,膽固醇與前列腺癌的發(fā)展有關(guān),但對前列腺癌細(xì)胞上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)的作用及潛在機(jī)制尚不清楚。了解膽固醇在前列腺癌轉(zhuǎn)移中的作用及具體機(jī)制,才能為前列腺癌的治療提供新的策略。

內(nèi)容概述:
2019年4月,中國科學(xué)院蘇州生物醫(yī)學(xué)工程技術(shù)研究所生物醫(yī)學(xué)診斷學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室在期刊Cancer Research(IF2019=9.727)上發(fā)表題為“Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR through APMAP”的最新論文。在這項(xiàng)研究中,研究者首次發(fā)現(xiàn)脂肪細(xì)胞質(zhì)膜相關(guān)蛋白APMAP在前列腺癌侵襲轉(zhuǎn)移中具有重要作用。APMAP通過減少EGFR的內(nèi)吞作用參與膽固醇誘導(dǎo)的前列腺癌細(xì)胞EMT。該發(fā)現(xiàn)可能為前列腺癌的診斷和治療提供新希望。
 
主要技術(shù):
RNA-seq、蛋白質(zhì)組學(xué)Co-IP、LC-MS/MS、細(xì)胞功能實(shí)驗(yàn)等
輝駿生物為本研究提供了Co-IPLC-MS/MS檢測和分析服務(wù)。

研究路線:

研究路線.jpg

 
研究結(jié)果:
1. 膽固醇誘導(dǎo)前列腺癌細(xì)胞EMT的發(fā)生依賴于ERK1/2的激活
研究者首先探索了膽固醇對前列腺癌細(xì)胞EMT、細(xì)胞遷移和侵襲的作用。采用膽固醇處理前列腺癌細(xì)胞后,作者發(fā)現(xiàn)EMT標(biāo)志物N-cadherin和vimentin的表達(dá)升高了,E-cadherin表達(dá)降低了,說明膽固醇會影響前列腺癌細(xì)胞的EMT;傷口愈合實(shí)驗(yàn)和transwell實(shí)驗(yàn)結(jié)果也表明膽固醇處理增加了細(xì)胞的遷移和侵襲(圖1C-D)。降血脂藥物辛伐他汀的處理逆轉(zhuǎn)了上述作用。
另外,通過對ERK1/2, AKT, TGFb和Wnt等幾種調(diào)控EMT的信號通路的檢測發(fā)現(xiàn):膽固醇處理可以使ERK1/2的磷酸化增加。后續(xù)的ERK1/2抑制劑實(shí)驗(yàn)也顯示,膽固醇誘導(dǎo)的細(xì)胞遷移和侵襲在兩種ERK抑制劑治療后發(fā)生逆轉(zhuǎn),這表明ERK信號通路在膽固醇誘導(dǎo)前列腺癌細(xì)胞EMT的過程中至關(guān)重要(圖1E-H)。

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2. 膽固醇促進(jìn)EGFR和APMAP在脂筏中積累
為了全面了解膽固醇對前列腺癌細(xì)胞基因表達(dá)的影響,研究者對膽固醇處理的PC-3細(xì)胞進(jìn)行了RNA-seq實(shí)驗(yàn),并對差異基因做了生物信息學(xué)分析,其中KEGG pathway分析結(jié)果顯示,差異基因主要富集在EGFR、WNT和VEGF信號通路中,而這些通路都參與了EMT(圖2A)。此外,GO富集分析表明膽固醇可能參與了膜筏相關(guān)的過程,如膜筏極化、定位和分布等(圖2B,C)。對前列腺癌細(xì)胞的免疫組化實(shí)驗(yàn)也表明膽固醇處理顯著增加了細(xì)胞表面脂筏的形成(圖2D)。
為了探索哪些蛋白質(zhì)參與了EMT過程,作者又采用標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)分析了膽固醇處理前后的PC-3細(xì)胞脂筏中的蛋白表達(dá)變化,發(fā)現(xiàn)ERK1/2的上游調(diào)節(jié)因子EGFR以及和結(jié)直腸癌轉(zhuǎn)移有關(guān)的APMAP蛋白在膽固醇處理后的脂筏中均有增加,western-blot實(shí)驗(yàn)也證實(shí)了這一結(jié)果(圖2E)。為進(jìn)一步確定APMAP是否參與EGFR的積累,將EGFR-RFP載體轉(zhuǎn)染至APMAP缺失的PC-3細(xì)胞和對照細(xì)胞,再用膽固醇處理。在對照細(xì)胞中,膽固醇處理增強(qiáng)了EGFR-RFP的熒光,而當(dāng)APMAP被敲除后,膽固醇對EGFR的影響幾乎完全被抑制(圖2F)。同時,APMAP的敲除削弱了EGFR的積累,從而降低了膽固醇誘導(dǎo)的ERK1/2磷酸化(圖2G)。這些數(shù)據(jù)表明,APMAP增加了前列腺癌細(xì)胞中由膽固醇誘導(dǎo)的EGFR的蛋白水平。

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3. APMAP通過EGFR促進(jìn)前列腺癌細(xì)胞EMT
接下來,研究者對APMAP基因敲除后的PC-3細(xì)胞進(jìn)行了RNA-seq實(shí)驗(yàn),對差異表達(dá)基因的功能分析顯示:它們富集在MAPK、Notch、粘附相關(guān)信號通路以及類固醇生物合成和膽固醇代謝過程中(圖3A),表明APMAP和膽固醇可能有重疊的功能。APMAP敲除顯著抑制了膽固醇誘導(dǎo)的細(xì)胞遷移、侵襲能力和EMT過程(圖3B-D)。相反,APMAP的過表達(dá)促進(jìn)了遷移和侵襲,而EGFR抑制劑則抑制了這一效應(yīng)(圖3E,F(xiàn))。此外,EGFR抑制劑顯著抑制了ERK1/2的激活,并抑制了APMAP過表達(dá)細(xì)胞中EMT標(biāo)志物的表達(dá)(圖3G)。體內(nèi)實(shí)驗(yàn)的結(jié)果與之類似,與對照組相比,注射膽固醇組的細(xì)胞明顯形成更多的肝轉(zhuǎn)移結(jié)節(jié)。膽固醇組的轉(zhuǎn)移瘤組織中,EGFR mRNA、APMAP和Vimentin的表達(dá)水平均顯著高于對照組,APMAP基因敲除顯著降低了它們的表達(dá)水平(圖3J,K)。這些數(shù)據(jù)表明APMAP通過調(diào)節(jié)EGFR參與膽固醇誘導(dǎo)的EMT過程。

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4. 膽固醇通過APMAP降低EGFR的內(nèi)吞
為了更好的確定膽固醇如何促進(jìn)脂筏中EGFR的積累,作者采用qRT-PCR技術(shù)分析了膽固醇對EGFR轉(zhuǎn)錄水平的影響,發(fā)現(xiàn)并無影響(圖4A),這說明APMAP對EGFR水平的調(diào)節(jié)發(fā)生在翻譯后。之后又用溶酶體抑制劑“氯喹”和/或膽固醇處理細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)當(dāng)不加氯喹時,膽固醇可以增加EGFR的水平,加入氯喹時,膽固醇的加入與否并不影響EGFR蛋白水平 (圖4B),說明膽固醇對EGFR的作用與氯喹相同,即抑制EGFR的降解。他們接著在膽固醇處理48h后,又采用蛋白質(zhì)翻譯抑制劑“環(huán)己酰亞胺”在不同時間處理細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)在APMAP敲除細(xì)胞中,膽固醇處理使EGFR的水平顯著降低了(圖4C)。
眾所周知EGFR的降解依賴于其內(nèi)吞,研究者推測膽固醇對EGFR降解的抑制是通過EGFR的內(nèi)吞實(shí)現(xiàn)的。間接免疫熒光結(jié)果顯示,膽固醇處理降低了EGFR和早期內(nèi)體標(biāo)志物Rab5在兩個細(xì)胞中的共定位(圖4D,E);APMAP-GFP與Rab5-RFP的共定位增加(圖4F)。接下來,作者探討了APMAP是否抑制EGFR的內(nèi)吞。轉(zhuǎn)染EGFR-GFP/Rab5-RFP和APMAP-GFP/Rab5-RFP至PC-3細(xì)胞,膽固醇處理后,APMAP沉默的細(xì)胞中EGFR與Rab5的共定位增加(圖4G)。這些數(shù)據(jù)表明,APMAP調(diào)節(jié)膽固醇介導(dǎo)的EGFR穩(wěn)定性。
 

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5. APMAP通過與EPS15R相互作用抑制EGFR內(nèi)吞
研究者又使用Co-IP和LC/MS-MS技術(shù)篩選了APMAP的結(jié)合蛋白,并對它們做了GO和pathway富集分析,數(shù)據(jù)表明APMAP參與了囊泡運(yùn)輸。由于EPS15R參與EGFR的內(nèi)吞,研究者首先通過Co-IP證實(shí)了內(nèi)源性APMAP與EPS15R的相互作用(圖5C),并且發(fā)現(xiàn)EPS15R的蛋白水平不受膽固醇的影響(圖5D),質(zhì)膜免疫熒光顯示,因膽固醇的加入,EPS15R與APMAP的相互作用增強(qiáng)(圖5F),并與EGFR解離(圖5G)。根據(jù)這些結(jié)果,研究者推測EPS15R在APMAP介導(dǎo)的EGFR降解中起關(guān)鍵作用。為驗(yàn)證假設(shè),他們在膽固醇處理的DU145細(xì)胞中進(jìn)行了APMAP沉默和/或EPS15R沉默,免疫熒光顯示,APMAP沉默促進(jìn)EGFR向早期內(nèi)體募集的作用被EPS15R的沉默所阻斷(圖5H)。在有膽固醇存在的APMAP沉默細(xì)胞中,EGFR的蛋白水平因EPS15R的沉默而恢復(fù)(圖5I)。這些結(jié)果表明,APMAP通過與EGFR競爭結(jié)合EPS15R,抑制EGFR內(nèi)吞到早期內(nèi)體,從而影響膽固醇誘導(dǎo)的EGFR蛋白的穩(wěn)定性。

圖5.png

 
6. APMAP在前列腺癌中顯著上調(diào)
為了了解APMAP在惡性腫瘤中的作用,研究者對15種癌癥中APMAP的轉(zhuǎn)錄水平進(jìn)行了分析,發(fā)現(xiàn)前列腺癌組織中APMAP的表達(dá)均顯著高于鄰近正常組織(圖6B)。ROC曲線分析顯示APMAP表達(dá)在預(yù)測前列腺癌組織與正常組織的敏感性和特異性(圖6C)。為探討APMAP在前列腺癌組織和正常組織中的表達(dá)情況,對80例前列腺癌患者和8例正常對照的組織芯片標(biāo)本進(jìn)行免疫組化染色。結(jié)果顯示與正常組織相比,前列腺癌組織中APMAP蛋白的表達(dá)增加(圖6D)。APMAP在腫瘤中的表達(dá)明顯增高,說明APMAP可作為前列腺癌的潛在診斷標(biāo)記物。

結(jié)論:
先前的研究發(fā)現(xiàn)膽固醇會增加侵襲性前列腺癌的患病風(fēng)險,本項(xiàng)目研究進(jìn)一步證明膽固介導(dǎo)APMAP上調(diào),進(jìn)而抑制EGFR降解,激活ERK1/2通路,從而促進(jìn)前列腺癌細(xì)胞EMT;提出APMAP可能是一種關(guān)鍵的調(diào)節(jié)劑,為高脂肪飲食、肥胖和癌癥轉(zhuǎn)移之間提供了聯(lián)系。                           

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